Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr4Q03142 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr4Q03142 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms