Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Cacna1sQ02789 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cacna1sQ02789 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1sQ02789 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms