Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Muc1Q02496 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Muc1Q02496 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms