Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ank1Q02357 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ank1Q02357 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms