Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcqQ02111 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms