Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mc1rQ01727 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mc1rQ01727 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms