Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp1Q01514 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms