Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms