Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EgfrQ01279 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms