Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col1a2Q01149 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col1a2Q01149 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms