Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelpQ01102 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SelpQ01102 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelpQ01102 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelpQ01102 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelpQ01102 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelpQ01102 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SelpQ01102 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelpQ01102 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SelpQ01102 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelpQ01102 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelpQ01102 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelpQ01102 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelpQ01102 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms