Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa1Q00623 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa1Q00623 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms