Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmmrQ00547 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HmmrQ00547 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms