Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp10Q000W5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms