Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds1P98191 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms