Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba2P98084 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apba2P98084 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba2P98084 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba2P98084 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba2P98084 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba2P98084 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba2P98084 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Apba2P98084 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba2P98084 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba2P98084 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms