Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn1bP97952 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms