Protein–RNA interactions for Protein: P97766

Cfc1, Cryptic protein, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfc1P97766 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfc1P97766 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfc1P97766 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms