Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps3aP97351 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps3aP97351 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms