Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbx1P82976 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbx1P82976 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms