Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb2P81117 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms