Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabpb2P81069 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms