Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx2P81066 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx2P81066 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx2P81066 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx2P81066 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms