Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct7P80313 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cct7P80313 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms