Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad1P70340 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad1P70340 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad1P70340 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smad1P70340 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad1P70340 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smad1P70340 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms