Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cux2P70298 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux2P70298 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux2P70298 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux2P70298 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux2P70298 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cux2P70298 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cux2P70298 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux2P70298 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux2P70298 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux2P70298 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms