Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprvP70289 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprvP70289 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprvP70289 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprvP70289 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprvP70289 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprvP70289 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprvP70289 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprvP70289 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PtprvP70289 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprvP70289 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprvP70289 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprvP70289 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprvP70289 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprvP70289 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms