Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim4P70271 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms