Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54lP70270 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms