Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SbdsP70122 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SbdsP70122 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbdsP70122 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms