Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtnP63089 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtnP63089 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtnP63089 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtnP63089 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtnP63089 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtnP63089 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtnP63089 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtnP63089 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtnP63089 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtnP63089 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtnP63089 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtnP63089 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtnP63089 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtnP63089 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtnP63089 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms