Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp2P63044 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms