Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms