Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms