Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23P62830 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23P62830 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl23P62830 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rpl23P62830 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl23P62830 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl23P62830 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23P62830 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23P62830 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23P62830 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl23P62830 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl23P62830 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms