Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab3cP62823 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3cP62823 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms