Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsnl1P62761 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsnl1P62761 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms