Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpeP62305 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpeP62305 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpeP62305 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms