Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tspan5P62080 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan5P62080 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms