Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copz1P61924 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms