Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf13P61216 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf13P61216 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf13P61216 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms