Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab5bP61021 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms