Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia3P60469 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia3P60469 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms