Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b6P59708 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms