Protein–RNA interactions for Protein: P59108

Cpne2, Copine-2, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne2P59108 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne2P59108 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne2P59108 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms