Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm2P58774 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms