Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strn4P58404 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strn4P58404 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strn4P58404 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms