Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gsc2P56916 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms