Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn18P56857 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn18P56857 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn18P56857 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn18P56857 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn18P56857 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn18P56857 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn18P56857 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn18P56857 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn18P56857 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn18P56857 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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