Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp2c40P56657 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp2c40P56657 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms